More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1705 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  100 
 
 
319 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  91.82 
 
 
319 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  91.82 
 
 
330 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  90.97 
 
 
321 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  90.97 
 
 
321 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  89.41 
 
 
321 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  84.29 
 
 
323 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  75.64 
 
 
313 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  69.97 
 
 
320 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  67.95 
 
 
316 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  66.03 
 
 
325 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  57.96 
 
 
326 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  61.09 
 
 
314 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  58.1 
 
 
316 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  60.2 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  58.54 
 
 
314 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  57.33 
 
 
312 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  57.33 
 
 
312 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  56.83 
 
 
312 aa  348  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  56.55 
 
 
311 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  54.26 
 
 
322 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  54.6 
 
 
318 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  55.91 
 
 
313 aa  338  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  54.29 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  55.73 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.29 
 
 
318 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  55.31 
 
 
317 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  55.45 
 
 
317 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  54.92 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  50.94 
 
 
321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  53.85 
 
 
318 aa  315  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  51.57 
 
 
316 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  51.57 
 
 
316 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  51.57 
 
 
316 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  50.98 
 
 
339 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  47.47 
 
 
315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 
318 aa  272  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  48.88 
 
 
320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  48.88 
 
 
320 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  46.77 
 
 
312 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
324 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  46.77 
 
 
312 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
315 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
315 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
315 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 
315 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  43.55 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  44.76 
 
 
315 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  43.55 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  43.18 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 
311 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 
311 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  45.21 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  42.22 
 
 
331 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
351 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.43 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 
324 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 
322 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  42.19 
 
 
339 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  40.75 
 
 
327 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  45.08 
 
 
338 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  41.2 
 
 
322 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  41.58 
 
 
334 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  38.26 
 
 
332 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  44.26 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  37.62 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  45.53 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 
338 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  38.85 
 
 
319 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 
326 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  44.31 
 
 
336 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 
344 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 
344 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  38.87 
 
 
319 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  40.58 
 
 
345 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  41.53 
 
 
322 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
344 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
334 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 
328 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  40.53 
 
 
375 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
344 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.26 
 
 
344 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  39.37 
 
 
321 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.26 
 
 
344 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.26 
 
 
344 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  41.73 
 
 
437 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 
354 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  38.26 
 
 
321 aa  188  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  39.43 
 
 
342 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 
334 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 
348 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 
321 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
387 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  38.38 
 
 
338 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 
321 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 
321 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>