More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3969 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 313 aa  634    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  93.55 
 
 		 311 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  64.29 
 
 		 314 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  63.11 
 
 		 314 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  62.58 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  61.81 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  62.46 
 
 		 316 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  62.46 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.97 
 
 		 318 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  60.65 
 
 		 318 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 317 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  59.35 
 
 		 318 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 316 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 316 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 316 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 319 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 323 aa  348  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  54.66 
 
 		 316 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  53.8 
 
 		 325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  55.91 
 
 		 319 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  57.01 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  55.31 
 
 		 318 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  54.66 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  55.59 
 
 		 320 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  55.59 
 
 		 320 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 339 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  49.03 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 324 aa  291  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 317 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 315 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  48.87 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  48.72 
 
 		 312 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 312 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 312 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 315 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 331 aa  268  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  47.42 
 
 		 310 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 		 311 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 		 311 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.61 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  41.8 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  42.95 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  43.95 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  41.85 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  41.77 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  39.37 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 336 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  41.21 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  44.59 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 387 aa  208  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  38.66 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  41.42 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 		 319 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  41.48 
 
 		 319 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  39.03 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 322 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 339 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  39.23 
 
 		 358 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  39.75 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  38.51 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  40.81 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>