More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0719 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 318 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  91.99 
 
 		 318 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  90.19 
 
 		 318 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  80.5 
 
 		 321 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  78.3 
 
 		 322 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  73.63 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  73.63 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  73.63 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  65.61 
 
 		 317 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  66.67 
 
 		 316 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  61.89 
 
 		 314 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  61.41 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  59.35 
 
 		 313 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  59.55 
 
 		 342 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  60.19 
 
 		 314 aa  364  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  58.58 
 
 		 317 aa  358  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  54.6 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 316 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  54.49 
 
 		 325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  56.09 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  56.09 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 323 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 319 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 313 aa  332  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 321 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  54.31 
 
 		 320 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  53.38 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  54.78 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  54.78 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  50.16 
 
 		 315 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 317 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  47.74 
 
 		 312 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  46.93 
 
 		 331 aa  258  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  47.1 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  45.6 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  45.6 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  47.7 
 
 		 312 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 335 aa  239  5.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  43.95 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.63 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  43.31 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 354 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  39.12 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  43.3 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  44.77 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  43.7 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  41.92 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 322 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 363 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  42.54 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  46.32 
 
 		 437 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  40.63 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 339 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  41.06 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  45.26 
 
 		 375 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  40.14 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  40.92 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  41.22 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>