More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4441 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  626  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  52.75 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  51.95 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 311 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  51.78 
 
 		 316 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  51.13 
 
 		 314 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 342 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 312 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  51.46 
 
 		 311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.3 
 
 		 318 aa  308  9e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  50.49 
 
 		 313 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 317 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  51.3 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  51.3 
 
 		 318 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  49.84 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  51.74 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 313 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 323 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 321 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  49.68 
 
 		 319 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  48.4 
 
 		 320 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  51.6 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  47.28 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  44.66 
 
 		 312 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 315 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 315 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  43.69 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  42.72 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  47.28 
 
 		 320 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  47.28 
 
 		 320 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  42.58 
 
 		 310 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.35 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  42.19 
 
 		 338 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  45.48 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 334 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 387 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 335 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  41.64 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 324 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 324 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 324 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  42.81 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  41.95 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  42.51 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 369 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 343 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  38.93 
 
 		 334 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  43.75 
 
 		 369 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 321 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 341 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 351 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  43.75 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  40.53 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  40 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  39.67 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>