More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4522 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  75.64 
 
 		 319 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  75.96 
 
 		 319 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  76.28 
 
 		 330 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  76.6 
 
 		 321 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  76.6 
 
 		 321 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  76.6 
 
 		 321 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  73.4 
 
 		 323 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  73.16 
 
 		 320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  72.52 
 
 		 316 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  69.87 
 
 		 325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  63.99 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  64.03 
 
 		 311 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  61.54 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  60.26 
 
 		 314 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  55.13 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  58.53 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  58.53 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 342 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  57.96 
 
 		 312 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  56.41 
 
 		 311 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  56.41 
 
 		 318 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 317 aa  342  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  55.77 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.77 
 
 		 318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  55.13 
 
 		 318 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  56.87 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  56.73 
 
 		 318 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 318 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  48.56 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  48.25 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 315 aa  257  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 322 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  44.52 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  45.19 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  43.37 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  43.37 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 324 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.78 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  40.46 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  40.84 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  40.73 
 
 		 338 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  40.27 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 345 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  45.38 
 
 		 327 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  40.45 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  43.97 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  44.67 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  40.29 
 
 		 342 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  42.66 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  43.49 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  38.39 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>