More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0128 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 314 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 317 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  66.24 
 
 		 314 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  65.59 
 
 		 316 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  63.75 
 
 		 311 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  63.11 
 
 		 313 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 311 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  62.66 
 
 		 317 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 342 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  60.52 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  60 
 
 		 322 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.52 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 313 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  60.19 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  60.19 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 330 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  58.86 
 
 		 319 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  60 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  58.54 
 
 		 319 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 321 aa  355  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  60.83 
 
 		 318 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 323 aa  351  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  59.37 
 
 		 321 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  59.37 
 
 		 321 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  56.91 
 
 		 316 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  58.47 
 
 		 318 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  55.95 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 316 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 316 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 316 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  55.52 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  56.09 
 
 		 320 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  56.09 
 
 		 320 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  49.35 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 324 aa  288  9e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 315 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 315 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  50.65 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  47.08 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  47.94 
 
 		 331 aa  265  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  46.96 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  45.78 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  45.78 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.08 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  45.75 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  44.29 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 338 aa  225  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  41.88 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  41.29 
 
 		 335 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 338 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  41.85 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  42.81 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  41.52 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.52 
 
 		 344 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.52 
 
 		 344 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  46.71 
 
 		 375 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  41.29 
 
 		 325 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  41.4 
 
 		 339 aa  215  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.21 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.21 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.21 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  45.8 
 
 		 437 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  41.01 
 
 		 319 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  41.01 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  41.35 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  42.47 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  42.64 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>