More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3160 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  75.4 
 
 		 318 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  75.4 
 
 		 318 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  73.63 
 
 		 318 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  69.45 
 
 		 322 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 321 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  65.71 
 
 		 316 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  60.77 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  60.13 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  59.15 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  59.15 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  59.16 
 
 		 314 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  57.37 
 
 		 312 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 311 aa  352  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 317 aa  348  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 330 aa  331  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 319 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 323 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 321 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 321 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 313 aa  328  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  54.06 
 
 		 321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  51.57 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  53.04 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 325 aa  318  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 339 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  53.7 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 312 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 312 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 318 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  47.59 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 324 aa  277  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  52.1 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  52.1 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  45.81 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 317 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  44.34 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  46.25 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 331 aa  248  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.72 
 
 		 338 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  41.92 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  49.19 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 387 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 335 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 354 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  42.12 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  42.21 
 
 		 339 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  39.49 
 
 		 319 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  45.53 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  46.28 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  47.33 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 351 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  46.07 
 
 		 437 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 363 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  48.35 
 
 		 369 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  48.35 
 
 		 369 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  48.35 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  43.15 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  36.53 
 
 		 336 aa  201  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  44.84 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  40.38 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>