More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0573 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  100 
 
 
342 aa  697    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  47.4 
 
 
338 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  48.12 
 
 
324 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  48.12 
 
 
324 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  48.28 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  48.12 
 
 
322 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.93 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  46.65 
 
 
334 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  45.73 
 
 
335 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  46.13 
 
 
339 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  46.91 
 
 
322 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  48.82 
 
 
363 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  47.84 
 
 
322 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 
338 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  47.13 
 
 
351 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  43.93 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  45.57 
 
 
319 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  47.03 
 
 
375 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  52.74 
 
 
437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  45.11 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  44.76 
 
 
338 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  43.22 
 
 
321 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  43.22 
 
 
321 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  46.75 
 
 
320 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  45.17 
 
 
343 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  45.17 
 
 
369 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.17 
 
 
369 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  45.17 
 
 
374 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  43.37 
 
 
334 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  45.17 
 
 
346 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  45.17 
 
 
346 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  45.17 
 
 
346 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
334 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
321 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  42.24 
 
 
325 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  43.67 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  44.72 
 
 
328 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 
336 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  44.51 
 
 
327 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 
328 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 
332 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  45.48 
 
 
333 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 
362 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  43.63 
 
 
327 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  42.19 
 
 
320 aa  235  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.16 
 
 
321 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  45.12 
 
 
328 aa  235  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  42.22 
 
 
341 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  42.14 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.85 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  41.34 
 
 
325 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  38.99 
 
 
354 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
338 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  39.38 
 
 
330 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 
334 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 
358 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  42.45 
 
 
319 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  39.43 
 
 
349 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  42.9 
 
 
327 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  41.72 
 
 
331 aa  225  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
344 aa  225  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 
320 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  43.52 
 
 
330 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  42.64 
 
 
357 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  40.61 
 
 
331 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  41.36 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  42.51 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  40.95 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.36 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.36 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.56 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.56 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.56 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  42.51 
 
 
356 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  38.68 
 
 
341 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  38.61 
 
 
320 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 
314 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
336 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 
331 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
348 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  40.37 
 
 
341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  40.31 
 
 
321 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 
317 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 
321 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  41.21 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  41.99 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 
372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
315 aa  212  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  44.48 
 
 
322 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>