More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0776 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
321 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
321 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
321 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
321 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  99.69 
 
 
321 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
321 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1912  AraC family transcriptional regulator  93.02 
 
 
215 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  60.51 
 
 
322 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  55.66 
 
 
327 aa  364  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  58.28 
 
 
338 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  60.51 
 
 
322 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  59.87 
 
 
324 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  59.24 
 
 
324 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  59.24 
 
 
324 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  58.28 
 
 
334 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  61.15 
 
 
322 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  57.01 
 
 
338 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  55.84 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  56.69 
 
 
338 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  57.01 
 
 
343 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  57.01 
 
 
369 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  57.01 
 
 
369 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  57.01 
 
 
346 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  57.01 
 
 
346 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  57.01 
 
 
346 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  56.69 
 
 
374 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  55.73 
 
 
327 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  58.92 
 
 
321 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  50.78 
 
 
327 aa  295  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  44.44 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  43.49 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  46.54 
 
 
335 aa  266  4e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
338 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  46.38 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  44.69 
 
 
338 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  42.22 
 
 
325 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
321 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  44.55 
 
 
332 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  42.76 
 
 
312 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 
312 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  44.88 
 
 
315 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
321 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
321 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  43.67 
 
 
317 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 
351 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  47.35 
 
 
310 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  43.51 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  44.16 
 
 
342 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  43.96 
 
 
339 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  44.54 
 
 
363 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  47.59 
 
 
437 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  44.97 
 
 
338 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  42.46 
 
 
375 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 
311 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 
311 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  47 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  40.13 
 
 
319 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  42.59 
 
 
341 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  43.9 
 
 
327 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  37.81 
 
 
330 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
336 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  42.46 
 
 
331 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
329 aa  228  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
320 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
312 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  43.99 
 
 
328 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  42.02 
 
 
334 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  44.03 
 
 
320 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  43.96 
 
 
330 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 
341 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  42.33 
 
 
334 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  39.5 
 
 
358 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  38.68 
 
 
349 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  36.78 
 
 
334 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  38.92 
 
 
354 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  41.64 
 
 
345 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  43.89 
 
 
336 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  43.89 
 
 
336 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 
344 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  43.89 
 
 
336 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 
344 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  41.72 
 
 
334 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 
344 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.32 
 
 
344 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.32 
 
 
344 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.32 
 
 
344 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 
311 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  38.59 
 
 
344 aa  219  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  41.04 
 
 
316 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 
357 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  38.56 
 
 
341 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 
319 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  42.01 
 
 
321 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  43.44 
 
 
348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
321 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>