More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06540  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  64.23 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23720  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  62.27 
 
 		 347 aa  352  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23500  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  61.9 
 
 		 306 aa  339  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  51.31 
 
 		 296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.389173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  38.78 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  44.94 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1223  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0726394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0296  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 135 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00196972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  36.96 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 760 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  36.36 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  36.78 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 530 aa  62  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  36.36 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 146 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  26.87 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 146 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 146 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1604  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.27 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000110  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827796  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  29.9 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  37.11 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.09 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  34.09 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.11 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.04 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 145 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  33 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.07 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>