More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23720 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23720  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 		 347 aa  703    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23500  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  66.79 
 
 		 306 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06540  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  62.27 
 
 		 278 aa  352  4e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  54.61 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  49.44 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.389173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  41.94 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1223  transcriptional regulator, AraC family  25.27 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0726394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  35.51 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0608  transcriptional regulator, AraC family protein  37.14 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  36.84 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0614  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45205 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0674  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0664  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.96 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3300  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3317  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00265  hypothetical protein  35.96 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  27.55 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  34.4 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0729  transcriptional regulator, AraC family protein  36.19 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0337  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0358  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.443979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  38.37 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0325  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  36.75 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0320  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  37.36 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0357  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.698953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 760 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4459  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.73 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 1201 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  22.5 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6896  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.33 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  36.45 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>