More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0608 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
305 aa  624  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 
303 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
305 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 
297 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
304 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
319 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  31.44 
 
 
289 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  35.98 
 
 
296 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0591  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
316 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 
299 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  38.66 
 
 
188 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 
303 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  39.01 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
299 aa  92.8  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
304 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
299 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  29.56 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6198  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 
285 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
154 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 
361 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  27.73 
 
 
293 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  29.65 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  32.31 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  32.61 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  30.41 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.32 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  40.54 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  34.35 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  35.46 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  44.94 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3315  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  hitchhiker  0.00000399067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  45.45 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  24.36 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  24.36 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  24.36 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  31.36 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  29.74 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0589  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  41.75 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>