More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0325 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0325  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 325 aa  654    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4771  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3978  transcriptional regulator, AraC family  32.01 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250001  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2321  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.612609 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  26.03 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17740  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.41 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.743146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1147  AraC family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 311 aa  86.3  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.98 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  27.33 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  46.34 
 
 		 164 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  32.35 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  28.76 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  32.33 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  31.14 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  36.36 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  28.64 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 154 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.33 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.59 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  45.68 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 519 aa  65.9  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 146 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 146 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5508  helix-turn-helix domain-containing protein  37.35 
 
 		 158 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 146 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4811  helix-turn-helix, AraC type  29.93 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  35 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 144 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  30.66 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  36.17 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  31.01 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  36.36 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  38.94 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  36.36 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23720  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.21 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0365  transcriptional regulator, AraC family  28.47 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>