More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4771 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4771  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 317 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0325  transcriptional regulator, AraC family  47.28 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3978  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.250001  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2321  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.612609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.42 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1147  AraC family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17740  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  22.74 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.743146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  25.57 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  29.88 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  32.28 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.24 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  21.43 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  28.83 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  27.85 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  26.18 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  23.88 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  29.82 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5741  helix-turn-helix domain-containing protein  31.18 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  24.8 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07340  putative transcriptional regulator  29 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  25.33 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  27.52 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  25.48 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  24.77 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2545  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  27.27 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  28.42 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.81 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  27.61 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1794  putative regulatory protein  30.61 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227844  normal  0.117823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1661  putative regulatory protein  30.61 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0701683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1796  putative regulatory protein  30.61 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.259376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1480  putative regulatory protein  30.61 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4602  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.488901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  29.17 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>