More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2680 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 329 aa  681    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  41.29 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.21 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  26.33 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  37.42 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  33.54 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  35.11 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  33.14 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.26 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  28.69 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  33.57 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  28.69 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  28.69 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  31.93 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 399 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  30.32 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 279 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  33.97 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  31.69 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  32.03 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2960  putative transcriptional regulator  24.66 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35070  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  32.03 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  29.56 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  25.25 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  37.27 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  25.63 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  30.66 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  30.58 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.17 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  24.02 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  23.97 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4441  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.440571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4074  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>