More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2099 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  100 
 
 		 319 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  53.99 
 
 		 322 aa  335  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  47.15 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1500  helix-turn-helix domain-containing protein  38.31 
 
 		 319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.546441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  41.01 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  34.93 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  27.49 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.38 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  38.6 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  46.46 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  42.57 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  35.61 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  34.51 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  34.51 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  28.77 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  24.38 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5371  transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  24.04 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  36.54 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  32.35 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.37 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  23.7 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  30.37 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  30.37 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0650  transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  30.37 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0866  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2545  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 399 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  31.86 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4575  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.44 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  21.18 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>