More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0681 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 357 aa  725    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  27.02 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  37.35 
 
 		 295 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  29.66 
 
 		 305 aa  96.3  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  36.75 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 313 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  34.01 
 
 		 279 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 313 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.8 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  34.9 
 
 		 323 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 330 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  36.91 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  36.91 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  30.9 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  36.91 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  27.87 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  29.59 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  25.78 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  24.42 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  25.31 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  39.45 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  27.61 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0021  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 234 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  23.93 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4321  helix-turn-helix domain-containing protein  23.73 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 277 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.08 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5912  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  33.06 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  35.05 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  21.85 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2797  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  32.38 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  35.35 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  28.71 
 
 		 1340 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  36.36 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  29.68 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>