More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0674 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 321 aa  671    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  37.2 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  33.54 
 
 		 295 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  36.2 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  33.54 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 326 aa  95.5  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.41 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  37.69 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  37.91 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.93 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  27.86 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  28.51 
 
 		 368 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  34.29 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  33.96 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  30.77 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  42 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  33.96 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  33.96 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  36.19 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  34.9 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  28.4 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.31 
 
 		 158 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  30.57 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0422  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  34.84 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  32.8 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  35.79 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  23.85 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0658  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  28.3 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 1201 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17740  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.55 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.743146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0632  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0334632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3954  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>