More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1107 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  84.51 
 
 
384 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  92.79 
 
 
399 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
398 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  58.58 
 
 
388 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  57.18 
 
 
361 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 
333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  36.6 
 
 
303 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 
314 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  35.15 
 
 
368 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 
350 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 
330 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 
382 aa  96.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  30.24 
 
 
332 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  25.57 
 
 
292 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 
312 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
319 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 
310 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  23.47 
 
 
337 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 
333 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 
329 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  28.92 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  32.53 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 
329 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25 
 
 
325 aa  86.7  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  25.78 
 
 
291 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 
278 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
308 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.66 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 
295 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  25.63 
 
 
318 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  37.98 
 
 
302 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2365  transcriptional regulator, AraC family  33.97 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417221  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
259 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  31.76 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  38.18 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  30.43 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  25.12 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  31.06 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  31.06 
 
 
323 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  31.06 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  31.76 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  30.26 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  41.24 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  29.79 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  28.07 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  27.09 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  32.51 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4604  two component transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  32.24 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  31.53 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  34.69 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5371  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  27.01 
 
 
320 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  24.55 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.71 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0021  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 
271 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2545  transcriptional regulator, AraC family  30.66 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>