More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 277 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 277 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 268 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  51.45 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 277 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  50.61 
 
 		 271 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  47.86 
 
 		 271 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4604  two component transcriptional regulator, AraC family  45.02 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  35.2 
 
 		 1388 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  31.15 
 
 		 1418 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  27.49 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  29.8 
 
 		 1366 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 407 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 441 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  26 
 
 		 1370 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 1341 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  32 
 
 		 1343 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 441 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  26.53 
 
 		 1335 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 961 aa  105  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.35 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  28.22 
 
 		 1376 aa  105  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  32.66 
 
 		 1201 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 386 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  45.76 
 
 		 373 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  29.6 
 
 		 1306 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2179  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  41.6 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 437 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.74 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  30.36 
 
 		 663 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 566 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 718 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 735 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 		 677 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 713 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 395 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.69 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 714 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  41.53 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  44.17 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 541 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  28.11 
 
 		 1378 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  27.13 
 
 		 1366 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.59 
 
 		 488 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.22 
 
 		 337 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  24.6 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.6 
 
 		 331 aa  99  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 440 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.33 
 
 		 593 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 541 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.33 
 
 		 593 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  28.46 
 
 		 1355 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  43.1 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  26 
 
 		 1340 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  26.21 
 
 		 1324 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4030  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000171088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 356 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 367 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 336 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  28.5 
 
 		 1374 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 363 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 553 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  27.64 
 
 		 1355 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 443 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 503 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 397 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4166  response regulator  36.29 
 
 		 508 aa  95.9  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  26.32 
 
 		 1400 aa  95.9  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 309 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  24.9 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.24 
 
 		 308 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  29.92 
 
 		 1378 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 		 365 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 140 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.97 
 
 		 1396 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.68 
 
 		 365 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 		 480 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  31.45 
 
 		 1298 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6015  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.48 
 
 		 333 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>