More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3829 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  96.61 
 
 		 714 aa  721    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  58.65 
 
 		 735 aa  757    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  91.67 
 
 		 718 aa  698    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  100 
 
 		 713 aa  1365    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  54.82 
 
 		 875 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4648  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 253 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0599  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0572  response regulator receiver domain-containing protein  30.87 
 
 		 488 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0607  response regulator receiver protein  30.87 
 
 		 488 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  30.79 
 
 		 317 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 292 aa  114  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0615  response regulator receiver protein  28.75 
 
 		 485 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.41 
 
 		 310 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 306 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 376 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.51 
 
 		 337 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 541 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 437 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 470 aa  104  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 312 aa  104  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 312 aa  104  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 312 aa  104  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 541 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.6 
 
 		 238 aa  103  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1510  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  37.32 
 
 		 269 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 361 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.28 
 
 		 356 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 240 aa  102  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 223 aa  101  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 		 228 aa  101  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  39.02 
 
 		 170 aa  101  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.78 
 
 		 480 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  40.65 
 
 		 248 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 		 224 aa  100  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 566 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  100  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  39.84 
 
 		 248 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 407 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 248 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0984  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 353 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.194443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 243 aa  100  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 553 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 242 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  39.55 
 
 		 247 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  40.65 
 
 		 248 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.97 
 
 		 230 aa  99.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 437 aa  99.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  47.79 
 
 		 295 aa  99.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  43.97 
 
 		 312 aa  99  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  47.22 
 
 		 513 aa  98.6  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 384 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  41.32 
 
 		 242 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  45.3 
 
 		 298 aa  99  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 454 aa  98.6  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.69 
 
 		 301 aa  99  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 305 aa  98.2  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.37 
 
 		 236 aa  98.6  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 239 aa  98.2  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 308 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  41.46 
 
 		 261 aa  98.2  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  36.62 
 
 		 231 aa  97.8  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 271 aa  97.8  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 		 236 aa  97.8  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 271 aa  97.8  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  32.08 
 
 		 230 aa  97.4  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  34.93 
 
 		 382 aa  97.4  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.12 
 
 		 235 aa  97.4  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 395 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 395 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  36.62 
 
 		 231 aa  97.4  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 		 236 aa  97.4  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  43.97 
 
 		 309 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 305 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 239 aa  97.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 235 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.02 
 
 		 239 aa  97.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 271 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 234 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 271 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 217 aa  96.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 271 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.29 
 
 		 488 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 301 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.22 
 
 		 305 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  39.55 
 
 		 241 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 223 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 241 aa  96.3  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 301 aa  96.3  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 309 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  35.94 
 
 		 204 aa  96.3  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  42.02 
 
 		 457 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 270 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3692  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.97 
 
 		 300 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 229 aa  95.5  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  41.41 
 
 		 1400 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 311 aa  95.5  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 349 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 301 aa  95.5  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>