More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1018 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 441 aa  906    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  92.74 
 
 		 441 aa  852    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.33 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 452 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 701 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 660 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 		 514 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 1341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 473 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 751 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 933 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 751 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 619 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 1255 aa  222  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 666 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 		 780 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 619 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 839 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 554 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 712 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 773 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  40.08 
 
 		 553 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.99 
 
 		 1306 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 756 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 741 aa  206  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 1171 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 780 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  37.76 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 1171 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 675 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 440 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  38.8 
 
 		 540 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  37.89 
 
 		 572 aa  186  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 635 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  39.62 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 437 aa  183  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 434 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 443 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  38.18 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  35.53 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  39.45 
 
 		 696 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  35.94 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  36.4 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  34.81 
 
 		 813 aa  179  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 930 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 409 aa  176  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  35.66 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 592 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  34.22 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  39.39 
 
 		 689 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 566 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  36.51 
 
 		 740 aa  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 503 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 541 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  34.58 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  36.73 
 
 		 617 aa  159  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  35.66 
 
 		 616 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  35.34 
 
 		 856 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 556 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.34 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 541 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 437 aa  152  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  35.98 
 
 		 508 aa  150  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  33.2 
 
 		 516 aa  150  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.45 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  33.48 
 
 		 728 aa  144  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  31.92 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  55.12 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  50.91 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.18 
 
 		 593 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.18 
 
 		 593 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1074  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 		 383 aa  137  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  49.62 
 
 		 200 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.59 
 
 		 222 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 202 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>