More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2945 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
514 aa  1053    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.59 
 
 
408 aa  293  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 
701 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.74 
 
 
473 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.18 
 
 
780 aa  279  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.44 
 
 
773 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
469 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.19 
 
 
1341 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.28 
 
 
441 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 
441 aa  260  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 
933 aa  257  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 
441 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 
452 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 
839 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 
360 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 
452 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
619 aa  250  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 
1171 aa  249  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 
441 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 
751 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 
1171 aa  246  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
751 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
619 aa  243  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
712 aa  243  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
660 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
666 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
1255 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
554 aa  237  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
756 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 
741 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  35.85 
 
 
553 aa  230  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
452 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
458 aa  223  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  42.31 
 
 
540 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
780 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  44.63 
 
 
689 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
434 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.44 
 
 
1306 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
675 aa  206  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  39.46 
 
 
532 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
635 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  38.78 
 
 
411 aa  194  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  38.02 
 
 
572 aa  192  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  39.13 
 
 
552 aa  192  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  39.15 
 
 
813 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3894  sensor histidine kinase  27.26 
 
 
543 aa  189  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
930 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  38.24 
 
 
407 aa  187  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  37.3 
 
 
542 aa  187  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 
543 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000746218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 
543 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.757334  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
592 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  38.37 
 
 
696 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
546 aa  183  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
556 aa  182  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
412 aa  179  8e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  36.08 
 
 
529 aa  179  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0736  ATPase domain-containing protein  26.55 
 
 
543 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000490957 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4005  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 
545 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000706341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 
543 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  34.98 
 
 
465 aa  176  7e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0817  histidine kinase  25.8 
 
 
543 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.874931  hitchhiker  0.000000000210514 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  35.36 
 
 
516 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  34.15 
 
 
394 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 
548 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0612019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
543 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3249  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 
546 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.632077 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
487 aa  167  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  38.06 
 
 
740 aa  166  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
498 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  36.61 
 
 
471 aa  163  9e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  35.53 
 
 
508 aa  161  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  36.32 
 
 
616 aa  162  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  37.29 
 
 
617 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  32.73 
 
 
394 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0543  ATP-binding region, ATPase-like protein  24.25 
 
 
534 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0505  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
530 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.903517  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
403 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  35.87 
 
 
246 aa  155  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  35.15 
 
 
728 aa  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  33.33 
 
 
856 aa  150  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1134  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.34 
 
 
819 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0216119  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  34.43 
 
 
687 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
503 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  35.14 
 
 
579 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1439  histidine kinase  32.92 
 
 
577 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2830  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
631 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 
721 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  26.48 
 
 
784 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
683 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  29.93 
 
 
403 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
881 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1484  sensory box sensor histidine kinase, putative  29.56 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
921 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>