More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4041 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  90.15 
 
 		 619 aa  1156    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 619 aa  1270    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 572 aa  323  8e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.88 
 
 		 859 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.04 
 
 		 853 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 		 839 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.45 
 
 		 1341 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 933 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.75 
 
 		 780 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.31 
 
 		 773 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 1171 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 469 aa  273  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 		 1171 aa  265  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 756 aa  260  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.19 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 441 aa  257  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.63 
 
 		 751 aa  252  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 		 741 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 		 452 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.63 
 
 		 751 aa  250  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 712 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 666 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 1255 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 514 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 554 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 		 458 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 675 aa  239  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 		 360 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 780 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 701 aa  230  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.91 
 
 		 1306 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 441 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 441 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 635 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  41.27 
 
 		 540 aa  209  9e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 660 aa  207  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  32.37 
 
 		 407 aa  201  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  40.32 
 
 		 553 aa  200  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  45.11 
 
 		 689 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  42.17 
 
 		 552 aa  197  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  36.62 
 
 		 516 aa  196  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 930 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  38.4 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  38.83 
 
 		 813 aa  192  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 		 1509 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 412 aa  188  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 475 aa  187  6e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  37.36 
 
 		 542 aa  186  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 409 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  37.55 
 
 		 465 aa  183  7e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  34.26 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  36.94 
 
 		 696 aa  182  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  33.59 
 
 		 572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 592 aa  181  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  36.73 
 
 		 394 aa  180  7e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 403 aa  180  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 404 aa  174  5.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  35.93 
 
 		 529 aa  171  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  35.22 
 
 		 394 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  34.63 
 
 		 856 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  36.36 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1990  histidine kinase  36.64 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.586982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  48.07 
 
 		 711 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.82 
 
 		 1094 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3541  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 655 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  44.22 
 
 		 658 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  35.87 
 
 		 246 aa  156  9e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  33.83 
 
 		 616 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  37.04 
 
 		 617 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  35.37 
 
 		 740 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 536 aa  153  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  42.58 
 
 		 608 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  42.58 
 
 		 608 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 487 aa  152  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  34.27 
 
 		 728 aa  150  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0849  putative two component sensor kinase  34.43 
 
 		 667 aa  150  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.8 
 
 		 856 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1379  histidine kinase  32.74 
 
 		 579 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138084  normal  0.0193369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 870 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 		 929 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  34.44 
 
 		 687 aa  144  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 		 1019 aa  144  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  43.79 
 
 		 730 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  27.96 
 
 		 1322 aa  142  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 797 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  49.28 
 
 		 1207 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  31.68 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1484  sensory box sensor histidine kinase, putative  31.54 
 
 		 403 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 921 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.66 
 
 		 855 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.045119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.37 
 
 		 778 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 608 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1439  histidine kinase  33.04 
 
 		 577 aa  137  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>