More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4666 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
608 aa  1252    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  39.15 
 
 
608 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  39.15 
 
 
608 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  35.5 
 
 
730 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  34.66 
 
 
1119 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
945 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
937 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 
1058 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  34.84 
 
 
872 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.48 
 
 
1207 aa  230  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  32.89 
 
 
967 aa  230  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  32.89 
 
 
967 aa  230  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31 
 
 
912 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  62.79 
 
 
711 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
1133 aa  223  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  62.21 
 
 
658 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
674 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
913 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
790 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  31.94 
 
 
1130 aa  215  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
1051 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 
1078 aa  210  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
816 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
1026 aa  200  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 
705 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
935 aa  171  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  31.9 
 
 
354 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
893 aa  153  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  40.35 
 
 
1322 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  51.82 
 
 
1094 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
885 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3541  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
655 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
893 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
619 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
901 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
900 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
768 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
619 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
870 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
1509 aa  134  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.26 
 
 
855 aa  131  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.045119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
900 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  40.62 
 
 
1207 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
572 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
856 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 
853 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  42.66 
 
 
840 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.15 
 
 
1262 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.18 
 
 
925 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
898 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
859 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1223 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0211  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.4 
 
 
1076 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
1069 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
929 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  24.49 
 
 
491 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
773 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
778 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.5 
 
 
714 aa  110  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
1070 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 
1070 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  23.8 
 
 
482 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  35.88 
 
 
2109 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.26 
 
 
1267 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00583  cyclic diguanylate phosphodiesterase  23.36 
 
 
848 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 
1648 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.09 
 
 
1130 aa  101  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1160  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.33 
 
 
475 aa  101  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
784 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.12 
 
 
561 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001909  GGDEF family protein  21.04 
 
 
848 aa  98.2  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  29.49 
 
 
408 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
536 aa  97.4  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.43 
 
 
1255 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
1439 aa  95.1  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
604 aa  94.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
1363 aa  94.7  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
426 aa  94.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1660  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.54 
 
 
997 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.933156 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1422  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 
652 aa  91.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  34.93 
 
 
1268 aa  91.3  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
1260 aa  91.3  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  31.91 
 
 
414 aa  90.1  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
1325 aa  90.1  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.57 
 
 
1239 aa  87.8  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
797 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
936 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1168 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
387 aa  87  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
691 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  30.13 
 
 
1113 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
631 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
833 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
769 aa  84.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2963  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.9 
 
 
1251 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
957 aa  84  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
1758 aa  84  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0211  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.1 
 
 
638 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.58 
 
 
1158 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.81 
 
 
833 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>