More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2273 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1223 aa  2424    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.77 
 
 
1070 aa  426  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1260 aa  373  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
870 aa  309  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
1064 aa  291  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
927 aa  289  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
916 aa  288  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.55 
 
 
1322 aa  285  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
928 aa  279  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
773 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
1033 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  31.75 
 
 
1297 aa  273  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
1310 aa  273  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.23 
 
 
1135 aa  272  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
1369 aa  271  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  32.8 
 
 
1014 aa  271  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  40.05 
 
 
2109 aa  271  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  32.92 
 
 
765 aa  267  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 
1340 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
780 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 
1258 aa  261  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
1165 aa  261  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 
1767 aa  260  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.05 
 
 
1499 aa  259  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
1765 aa  259  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
745 aa  258  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
1767 aa  257  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
919 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.68 
 
 
2213 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  30.03 
 
 
1574 aa  254  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.59 
 
 
918 aa  254  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.59 
 
 
918 aa  254  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.59 
 
 
918 aa  254  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.59 
 
 
918 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.59 
 
 
918 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.35 
 
 
932 aa  253  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
1069 aa  252  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
738 aa  251  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.2 
 
 
937 aa  252  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.47 
 
 
1442 aa  251  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  31.54 
 
 
932 aa  251  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.8 
 
 
918 aa  250  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
770 aa  249  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  33.6 
 
 
1407 aa  249  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  28.84 
 
 
2035 aa  247  8e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.13 
 
 
923 aa  247  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
1788 aa  247  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
1193 aa  247  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  29.3 
 
 
1119 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
936 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
1230 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  31.97 
 
 
905 aa  246  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.03 
 
 
933 aa  245  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.03 
 
 
933 aa  245  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
1314 aa  245  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.03 
 
 
932 aa  245  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  34.3 
 
 
1021 aa  244  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.03 
 
 
933 aa  244  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
920 aa  244  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
909 aa  244  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
916 aa  244  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
1316 aa  244  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  29.91 
 
 
918 aa  243  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
918 aa  243  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.91 
 
 
918 aa  243  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.91 
 
 
918 aa  243  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.91 
 
 
918 aa  243  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.91 
 
 
918 aa  243  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1548 aa  243  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  33.45 
 
 
650 aa  243  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  29.91 
 
 
918 aa  243  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.91 
 
 
918 aa  243  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.91 
 
 
918 aa  243  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  29.37 
 
 
1200 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
1560 aa  242  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  37.88 
 
 
1193 aa  241  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  30.2 
 
 
891 aa  241  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
752 aa  241  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  32.19 
 
 
737 aa  241  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1820 aa  241  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.7 
 
 
982 aa  239  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.7 
 
 
929 aa  239  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.11 
 
 
918 aa  239  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
1236 aa  239  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.83 
 
 
937 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.22 
 
 
952 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
1162 aa  238  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
841 aa  238  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  33.9 
 
 
977 aa  238  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.5 
 
 
906 aa  238  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
1131 aa  237  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1234 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
1245 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
833 aa  237  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
917 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.14 
 
 
927 aa  236  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
1374 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
1234 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
1240 aa  234  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  30.18 
 
 
1439 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>