More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0139 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  66.03 
 
 		 754 aa  924    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  65.23 
 
 		 757 aa  901    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  65.03 
 
 		 752 aa  957    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 745 aa  1499    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  62.41 
 
 		 649 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  61.38 
 
 		 650 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  59.55 
 
 		 636 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 		 744 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 686 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 700 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.19 
 
 		 708 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  41.44 
 
 		 693 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.18 
 
 		 713 aa  422  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.2 
 
 		 676 aa  412  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1069 aa  369  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 		 744 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 1369 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 916 aa  350  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1363 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 1550 aa  334  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1064 aa  334  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1313 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 		 929 aa  331  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 1433 aa  330  8e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 816 aa  325  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  40.43 
 
 		 1177 aa  324  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 950 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 925 aa  324  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 770 aa  322  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 830 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1202 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.81 
 
 		 1322 aa  320  5e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 		 928 aa  320  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 1305 aa  320  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.37 
 
 		 852 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.31 
 
 		 1135 aa  319  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 946 aa  319  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.85 
 
 		 1442 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 		 1611 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 1767 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 1767 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1603 aa  314  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 1397 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  38.79 
 
 		 847 aa  313  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1820 aa  313  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.07 
 
 		 929 aa  312  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 1622 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0051  histidine kinase  35.84 
 
 		 760 aa  311  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 835 aa  310  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 1771 aa  310  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 936 aa  310  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.75 
 
 		 1014 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 1767 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  35.63 
 
 		 1407 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.49 
 
 		 957 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1040 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 985 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1033 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 1582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1049 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 		 1118 aa  308  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.64 
 
 		 1763 aa  308  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1130 aa  308  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 		 1480 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.38 
 
 		 1765 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0036  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 759 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.488776  normal  0.166978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  34.97 
 
 		 1626 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1788 aa  305  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 		 812 aa  304  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 833 aa  303  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 927 aa  303  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 1768 aa  303  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 1284 aa  303  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  39.32 
 
 		 918 aa  303  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.85 
 
 		 2213 aa  302  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 1784 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 1266 aa  302  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0027  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 739 aa  302  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.93 
 
 		 923 aa  302  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 1267 aa  302  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1384 aa  302  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  40.47 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  39.23 
 
 		 727 aa  301  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1560 aa  300  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 758 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 993 aa  300  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  39.27 
 
 		 918 aa  300  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.84 
 
 		 1468 aa  300  9e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.39 
 
 		 941 aa  300  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  37.52 
 
 		 925 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  37.75 
 
 		 1346 aa  299  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  38.22 
 
 		 977 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  39.59 
 
 		 850 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 1792 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  38.1 
 
 		 905 aa  298  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1326 aa  296  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1786 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 1782 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  35 
 
 		 950 aa  296  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1287 aa  296  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>