81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4664 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  100 
 
 		 491 aa  1011    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  79.66 
 
 		 482 aa  779    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  31.39 
 
 		 1130 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  27.56 
 
 		 1133 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 		 937 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 674 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 		 1207 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 		 1058 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  29.7 
 
 		 872 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  26.79 
 
 		 967 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  26.79 
 
 		 967 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  26.51 
 
 		 730 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 		 790 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 912 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  27.91 
 
 		 1119 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0452  HAMP domain-containing protein  25.36 
 
 		 489 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 935 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 913 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 945 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  25.35 
 
 		 705 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.55 
 
 		 1078 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  24.49 
 
 		 608 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 		 816 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  27.78 
 
 		 354 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 1026 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 1051 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  28.2 
 
 		 608 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  28.2 
 
 		 608 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1747  putative sensor with HAMP domain  21.78 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1137  histidine kinase, HAMP region  32.94 
 
 		 458 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4286  putative sensor with HAMP domain protein  34.67 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1258  sensor protein  35.42 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  38.39 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3806  hypothetical protein  39.56 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3757  hypothetical protein  39.56 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2800  putative sensor with HAMP domain protein  49.21 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0999492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.86 
 
 		 1130 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  51.11 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0619  methyl-accepting chemotaxis protein  23.4 
 
 		 696 aa  59.3  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00139031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.11 
 
 		 668 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.481177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  22.02 
 
 		 702 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 906 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 894 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00583  cyclic diguanylate phosphodiesterase  20.99 
 
 		 848 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 880 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  22.51 
 
 		 701 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  23.01 
 
 		 701 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  19.86 
 
 		 768 aa  50.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.95 
 
 		 788 aa  50.4  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.925334  normal  0.122382 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.53 
 
 		 609 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0855945 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 639 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  22.77 
 
 		 705 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1284  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  23.4 
 
 		 707 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 875 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20.18 
 
 		 609 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  27.05 
 
 		 726 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  22.64 
 
 		 643 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  20.18 
 
 		 608 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.97 
 
 		 609 aa  47  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.64 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.74 
 
 		 637 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.13 
 
 		 242 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 639 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.79 
 
 		 678 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  20.83 
 
 		 708 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  23.03 
 
 		 695 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  36.05 
 
 		 1142 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  36.05 
 
 		 1142 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  32.63 
 
 		 662 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3100  chemotaxis sensory transducer  21.51 
 
 		 652 aa  44.3  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.594551  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  24.62 
 
 		 639 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.22 
 
 		 628 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.62 
 
 		 655 aa  43.9  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 738 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 488 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  29.21 
 
 		 624 aa  43.5  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 639 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  27.43 
 
 		 664 aa  43.5  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2322  GGDEF family protein  23.37 
 
 		 849 aa  43.5  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0433  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.67 
 
 		 776 aa  43.1  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>