146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0131 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  100 
 
 
354 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  43.3 
 
 
967 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  43.3 
 
 
967 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
1026 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
937 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  40.97 
 
 
1119 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  37.21 
 
 
872 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
674 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  34.94 
 
 
1207 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  39.07 
 
 
608 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  39.07 
 
 
608 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  38.69 
 
 
705 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
912 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  35.07 
 
 
1130 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 
1078 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
790 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
1051 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
945 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
935 aa  179  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  32.85 
 
 
730 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
1058 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
913 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  31.83 
 
 
1133 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 
608 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
816 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  29.33 
 
 
482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00583  cyclic diguanylate phosphodiesterase  29.6 
 
 
848 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001909  GGDEF family protein  25.07 
 
 
848 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 
1130 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  27.78 
 
 
491 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2322  GGDEF family protein  24.21 
 
 
849 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3824  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.27 
 
 
877 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668765  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  25.73 
 
 
702 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  23.12 
 
 
701 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  22.01 
 
 
701 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0452  HAMP domain-containing protein  23.46 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3387  adenylate/guanylate cyclase  25.13 
 
 
781 aa  72.8  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
875 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
894 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.83 
 
 
658 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 
906 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
768 aa  62.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1747  putative sensor with HAMP domain  22.74 
 
 
467 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  26.46 
 
 
652 aa  59.7  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 
695 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
646 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  31.91 
 
 
705 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  29.6 
 
 
712 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  23.16 
 
 
645 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  34.94 
 
 
665 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  32.93 
 
 
644 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.84 
 
 
626 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  25.26 
 
 
708 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.53 
 
 
632 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 
648 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 
621 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.33 
 
 
698 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 
880 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
695 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00207311  hitchhiker  0.0002457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.95 
 
 
626 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.95 
 
 
626 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 
705 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 
655 aa  50.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 
655 aa  50.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1273  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.94 
 
 
609 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258977  normal  0.0501221 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0556  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.43 
 
 
690 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 
695 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0484461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.46 
 
 
628 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.46 
 
 
643 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.34 
 
 
668 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.481177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.46 
 
 
628 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  26.02 
 
 
657 aa  49.7  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.43 
 
 
690 aa  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  32.53 
 
 
624 aa  49.7  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.16 
 
 
678 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  27.83 
 
 
626 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.83 
 
 
626 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.47 
 
 
808 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.92 
 
 
630 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.22 
 
 
597 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0423277  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.4 
 
 
630 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0347  methyl-accepting chemotaxis protein DmcA  26.72 
 
 
729 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  32.63 
 
 
646 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 
646 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  26.45 
 
 
643 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.43 
 
 
609 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.08 
 
 
678 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.4 
 
 
630 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.4 
 
 
630 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  30.23 
 
 
664 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  21.28 
 
 
604 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  22.97 
 
 
630 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3209  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  28.02 
 
 
601 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.4 
 
 
630 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  20.51 
 
 
726 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
940 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  23.33 
 
 
1065 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.97 
 
 
644 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26340  cyclic di-GMP signal transduction protein  31.03 
 
 
1104 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.495435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  32.5 
 
 
627 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>