More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3541 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3541  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
655 aa  1345    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
778 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3542  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
464 aa  233  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743078  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
384 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5069  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.21 
 
 
748 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  63.7 
 
 
1094 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2624  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
744 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3479  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
744 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  57.97 
 
 
658 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  46.24 
 
 
1322 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
631 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  56.2 
 
 
855 aa  171  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.045119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  56.93 
 
 
608 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  56.2 
 
 
608 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  57.86 
 
 
711 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 
395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 
395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 
870 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  57.45 
 
 
1207 aa  162  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.82 
 
 
1262 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 
619 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.72 
 
 
714 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.73 
 
 
619 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  51.13 
 
 
730 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.83 
 
 
1509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
604 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  45.89 
 
 
608 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.79 
 
 
925 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 
929 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.35 
 
 
856 aa  145  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 
572 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  47.65 
 
 
840 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.83 
 
 
853 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
900 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
901 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.07 
 
 
859 aa  134  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
885 aa  134  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
900 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.33 
 
 
778 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0211  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.54 
 
 
1076 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  28.12 
 
 
2109 aa  128  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
893 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1955  histidine kinase  38.54 
 
 
357 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1928  histidine kinase  38.54 
 
 
357 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
898 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
518 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.315276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.83 
 
 
1069 aa  124  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
797 aa  124  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  40 
 
 
893 aa  123  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
784 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
570 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
1363 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 
643 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  39.1 
 
 
408 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.88 
 
 
773 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
536 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
1070 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  35.83 
 
 
352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 
1369 aa  113  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 
456 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 
1526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.28 
 
 
1255 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
384 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
838 aa  110  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
601 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
1223 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
601 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
549 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
407 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
1195 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
674 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
361 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
463 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
535 aa  108  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  38.51 
 
 
391 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 
763 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
514 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
566 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
579 aa  107  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
883 aa  107  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
973 aa  107  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
929 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
483 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
592 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
380 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
610 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
767 aa  106  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  26.7 
 
 
1053 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
1064 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  33.68 
 
 
993 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0208  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
379 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
426 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
827 aa  106  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1431  sensory box sensor histidine kinase  35.23 
 
 
392 aa  106  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
637 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  34.24 
 
 
356 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>