More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1335 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 1113 aa  2289    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  77.82 
 
 		 1253 aa  443  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 1301 aa  423  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.61 
 
 		 862 aa  303  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.93 
 
 		 1078 aa  302  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 		 766 aa  301  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  44.19 
 
 		 376 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.93 
 
 		 1439 aa  270  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  51.32 
 
 		 511 aa  265  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.56 
 
 		 1039 aa  264  8e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 813 aa  260  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.48 
 
 		 768 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  37.3 
 
 		 848 aa  251  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 896 aa  235  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  38.69 
 
 		 400 aa  233  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 901 aa  222  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 1325 aa  218  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  32.77 
 
 		 565 aa  217  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 1692 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.52 
 
 		 1275 aa  199  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 608 aa  197  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  36.56 
 
 		 458 aa  196  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.26 
 
 		 660 aa  195  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  29.15 
 
 		 637 aa  193  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 878 aa  193  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 771 aa  190  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  35.98 
 
 		 461 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  46.11 
 
 		 524 aa  181  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.73 
 
 		 1158 aa  179  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.94 
 
 		 1426 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 603 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 784 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 1265 aa  179  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 1309 aa  178  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 		 909 aa  177  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.3 
 
 		 1338 aa  177  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 1509 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.31 
 
 		 530 aa  175  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 1080 aa  175  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  50.62 
 
 		 200 aa  171  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 1121 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 		 769 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 1390 aa  169  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  36.8 
 
 		 477 aa  168  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  27.52 
 
 		 707 aa  167  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 931 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  36.24 
 
 		 849 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 		 593 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 789 aa  165  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.33 
 
 		 653 aa  165  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.96 
 
 		 781 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3517  putative PAS/PAC sensor protein  54.73 
 
 		 463 aa  164  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 		 535 aa  164  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 650 aa  164  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 		 1419 aa  163  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 		 886 aa  162  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.62 
 
 		 971 aa  162  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.64 
 
 		 1471 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 1168 aa  161  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  43.09 
 
 		 474 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 		 984 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2963  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.15 
 
 		 1251 aa  159  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 603 aa  159  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.4 
 
 		 1413 aa  158  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  46.11 
 
 		 837 aa  158  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.41 
 
 		 644 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  52.11 
 
 		 440 aa  157  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 		 873 aa  157  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  56.25 
 
 		 669 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 		 1513 aa  157  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 930 aa  157  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 		 544 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  43.68 
 
 		 402 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1120  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 805 aa  156  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  51.72 
 
 		 186 aa  156  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  35.25 
 
 		 914 aa  155  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  29.67 
 
 		 1109 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  27.85 
 
 		 906 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 		 844 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 		 844 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  26.28 
 
 		 883 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 651 aa  151  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0236  putative PAS/PAC sensor protein  54.07 
 
 		 468 aa  151  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 		 1122 aa  151  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 500 aa  151  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 761 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 1032 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  30.65 
 
 		 749 aa  149  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 		 765 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.76 
 
 		 880 aa  147  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.89 
 
 		 853 aa  147  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.01 
 
 		 860 aa  147  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  46.79 
 
 		 803 aa  146  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 		 1111 aa  146  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.93 
 
 		 1094 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 980 aa  145  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  27.84 
 
 		 1207 aa  145  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2998  hypothetical protein  40.62 
 
 		 326 aa  144  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00400405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 2072 aa  144  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 535 aa  144  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>