More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1709 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 669 aa  1379    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 783 aa  243  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 1032 aa  229  9e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  39.69 
 
 		 812 aa  223  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 657 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 653 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 656 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  27.44 
 
 		 906 aa  200  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 1325 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 544 aa  196  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 		 440 aa  183  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 781 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 768 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.88 
 
 		 1078 aa  164  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.88 
 
 		 769 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.34 
 
 		 771 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  49.7 
 
 		 637 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  56.25 
 
 		 1113 aa  157  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 		 660 aa  155  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 789 aa  155  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.74 
 
 		 1301 aa  154  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  55.22 
 
 		 837 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  54.14 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  55.65 
 
 		 186 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 766 aa  151  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 		 862 aa  150  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  51.91 
 
 		 200 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.2 
 
 		 1253 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.7 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 608 aa  145  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.96 
 
 		 1426 aa  144  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.35 
 
 		 886 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 		 1439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.03 
 
 		 593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  54.33 
 
 		 849 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.29 
 
 		 873 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 644 aa  140  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  44.65 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 		 603 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  50.82 
 
 		 909 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 		 813 aa  138  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  51.64 
 
 		 400 aa  135  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.69 
 
 		 1039 aa  135  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 603 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  50.4 
 
 		 1265 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  51.97 
 
 		 268 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 		 1513 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 896 aa  133  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  46.72 
 
 		 376 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.55 
 
 		 720 aa  132  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 753 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  44.76 
 
 		 402 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.22 
 
 		 931 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 401 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 765 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.16 
 
 		 1111 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  41.61 
 
 		 196 aa  127  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  45.59 
 
 		 559 aa  127  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 		 896 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 550 aa  125  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 1276 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 472 aa  123  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 901 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 984 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 		 1039 aa  120  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  45.24 
 
 		 458 aa  120  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 759 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 980 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 		 2072 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 		 764 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  41.91 
 
 		 474 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 763 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 878 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  47.41 
 
 		 178 aa  115  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  44.7 
 
 		 483 aa  115  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 596 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 		 619 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  40.29 
 
 		 461 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 1121 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  41.86 
 
 		 287 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  40.71 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  43.8 
 
 		 127 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 737 aa  108  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 657 aa  108  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 		 1425 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 		 632 aa  106  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 		 1045 aa  104  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1697  response regulator receiver protein  51.43 
 
 		 164 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.359972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.21 
 
 		 869 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 773 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 347 aa  98.2  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.17 
 
 		 869 aa  97.4  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 758 aa  96.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  38.41 
 
 		 477 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 394 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  40.48 
 
 		 149 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  25.15 
 
 		 455 aa  95.1  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 396 aa  94.7  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 396 aa  94.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>