More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2756 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
402 aa  819    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
500 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 
593 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 
771 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
886 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.35 
 
 
769 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
660 aa  162  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  43.41 
 
 
637 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  43.82 
 
 
1113 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
896 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
608 aa  157  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  48.32 
 
 
1265 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 
653 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 
1078 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  44.38 
 
 
511 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 
768 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
931 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
524 aa  153  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  45.65 
 
 
186 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
1439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
1426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
862 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
1301 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.68 
 
 
544 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 
603 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.19 
 
 
1039 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.82 
 
 
530 aa  149  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
984 aa  149  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 
766 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  41.99 
 
 
849 aa  149  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  49.31 
 
 
200 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  37.83 
 
 
440 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
909 aa  146  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
789 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 
603 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
1253 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
873 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
813 aa  144  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  35.65 
 
 
400 aa  143  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  44.74 
 
 
812 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
1032 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  37.04 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  45 
 
 
559 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 
763 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  42.17 
 
 
669 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
657 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
1111 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  38.12 
 
 
376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
268 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  42.13 
 
 
458 aa  133  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 
781 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
1513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
753 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
550 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  42.67 
 
 
474 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 
765 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 
1276 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
783 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
720 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  47.62 
 
 
196 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
644 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  44.93 
 
 
837 aa  126  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 
901 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.33 
 
 
1325 aa  126  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  28.66 
 
 
559 aa  125  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 
2072 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
656 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
878 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 
1039 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
758 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
1121 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
759 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
980 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
619 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  44.26 
 
 
127 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
921 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  36.13 
 
 
479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  44.35 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
596 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
1425 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  40.13 
 
 
906 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  42.22 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  31.02 
 
 
477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  39.05 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
477 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  42.64 
 
 
178 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
1045 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
764 aa  106  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
737 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  36.13 
 
 
632 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
657 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
896 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2267  putative PAS/PAC sensor protein  30.05 
 
 
576 aa  90.5  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0262742  normal  0.128517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.48 
 
 
700 aa  87  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1697  response regulator receiver protein  41.57 
 
 
164 aa  86.3  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.359972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  37.21 
 
 
133 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
685 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
875 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>