More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2215 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 637 aa  1305    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.89 
 
 		 603 aa  409  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 980 aa  250  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 769 aa  250  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 660 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 608 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 1111 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 909 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 1426 aa  210  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 1439 aa  207  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 771 aa  206  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 1301 aa  204  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 603 aa  203  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 931 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 766 aa  201  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  31.22 
 
 		 812 aa  200  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 873 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  40.71 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 768 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  28.12 
 
 		 849 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  29.15 
 
 		 1113 aa  193  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 896 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 783 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  35.31 
 
 		 837 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 1078 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 753 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 1513 aa  187  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 593 aa  187  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 862 aa  186  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 3706 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 1039 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 1253 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  41.76 
 
 		 1265 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  38.06 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 789 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 500 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 984 aa  180  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 524 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 596 aa  176  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 886 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 653 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 656 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 781 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 472 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  50.99 
 
 		 401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 765 aa  163  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 904 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 720 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  37.28 
 
 		 376 aa  161  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.44 
 
 		 1442 aa  161  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  34.73 
 
 		 474 aa  160  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.86 
 
 		 544 aa  160  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  50.88 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  49.7 
 
 		 669 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  57.04 
 
 		 200 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.69 
 
 		 644 aa  157  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  43.5 
 
 		 402 aa  157  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  55.63 
 
 		 268 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 		 1032 aa  153  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.59 
 
 		 657 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  54.41 
 
 		 559 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 1121 aa  150  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.38 
 
 		 763 aa  150  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  56 
 
 		 186 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  28.06 
 
 		 2361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 1177 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 813 aa  147  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.47 
 
 		 901 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 2072 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 1559 aa  144  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 		 550 aa  144  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 1654 aa  143  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 1425 aa  143  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 841 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.08 
 
 		 1561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 		 983 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 		 968 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  62.5 
 
 		 1325 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1120  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 805 aa  141  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  30.19 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 1452 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  52.34 
 
 		 196 aa  138  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 2693 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  25.65 
 
 		 1379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.72 
 
 		 1258 aa  135  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1051 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 878 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.99 
 
 		 813 aa  135  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  32.07 
 
 		 483 aa  134  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 856 aa  134  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  26.84 
 
 		 632 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 883 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 		 1276 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 1418 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 2654 aa  131  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 		 1965 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 		 1603 aa  130  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 769 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  26.09 
 
 		 1258 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>