More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2464 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  70.78 
 
 		 783 aa  845    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.02 
 
 		 1032 aa  926    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 812 aa  1669    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  69.18 
 
 		 657 aa  634  1e-180  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  67.89 
 
 		 656 aa  626  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 1253 aa  425  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.09 
 
 		 653 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  33.59 
 
 		 906 aa  363  6e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 1325 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 		 530 aa  291  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 544 aa  272  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  38.8 
 
 		 440 aa  252  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  39.69 
 
 		 669 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 781 aa  221  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 1262 aa  213  9e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.2 
 
 		 1258 aa  205  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 896 aa  204  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  31.22 
 
 		 637 aa  200  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 769 aa  194  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 1050 aa  189  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 		 1258 aa  181  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.27 
 
 		 1078 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  58.67 
 
 		 849 aa  171  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  30.22 
 
 		 1301 aa  162  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 862 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 1126 aa  161  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  30.05 
 
 		 559 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 773 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.85 
 
 		 1439 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.3 
 
 		 1301 aa  157  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  62.88 
 
 		 511 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.23 
 
 		 768 aa  156  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.68 
 
 		 766 aa  155  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.47 
 
 		 660 aa  155  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.68 
 
 		 593 aa  154  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 604 aa  154  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  55.94 
 
 		 376 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  57.14 
 
 		 837 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  32.07 
 
 		 1171 aa  152  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 603 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.29 
 
 		 771 aa  150  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.6 
 
 		 1426 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56 
 
 		 896 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  48.08 
 
 		 200 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  28.8 
 
 		 1346 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  56.8 
 
 		 1265 aa  147  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.55 
 
 		 603 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  46.79 
 
 		 400 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 		 789 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 644 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  25.85 
 
 		 1061 aa  145  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 		 1039 aa  145  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34 
 
 		 1051 aa  144  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 268 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 		 909 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 759 aa  142  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.67 
 
 		 931 aa  142  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46 
 
 		 1253 aa  142  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0458  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.48 
 
 		 1037 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.26 
 
 		 873 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.8 
 
 		 500 aa  140  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.64 
 
 		 608 aa  139  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  44.59 
 
 		 401 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  52 
 
 		 186 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 1513 aa  139  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.18 
 
 		 813 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  45.62 
 
 		 196 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  45.21 
 
 		 402 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  51.2 
 
 		 1113 aa  138  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.26 
 
 		 1111 aa  138  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.97 
 
 		 984 aa  137  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 765 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  25.73 
 
 		 1062 aa  135  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 753 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.17 
 
 		 763 aa  134  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 1629 aa  134  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 		 901 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.18 
 
 		 886 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4344  PAS:GGDEF  29.01 
 
 		 707 aa  132  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 1648 aa  132  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 1080 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 1135 aa  130  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 1352 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 2072 aa  128  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 776 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 		 524 aa  127  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55 
 
 		 720 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.32 
 
 		 853 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  35.68 
 
 		 980 aa  125  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 741 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 		 980 aa  124  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0472  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.56 
 
 		 853 aa  124  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000400428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 764 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.39 
 
 		 564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 770 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 1276 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.03 
 
 		 989 aa  121  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 1224 aa  120  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.48 
 
 		 637 aa  120  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>