More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1127 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
989 aa  1996    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.28 
 
 
926 aa  522  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.04 
 
 
1222 aa  479  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.76 
 
 
634 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 
630 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
759 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
1432 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 
1418 aa  415  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
838 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 
1021 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 
1122 aa  412  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.99 
 
 
714 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 
576 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 
935 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
1344 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.73 
 
 
1081 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
873 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 
647 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
703 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 
1070 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
1070 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 
760 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
1428 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
712 aa  347  5e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
682 aa  331  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 
654 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  30.3 
 
 
1005 aa  307  5.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
991 aa  303  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
810 aa  292  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
1113 aa  289  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
557 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
1108 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
642 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
1260 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1260 aa  280  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
776 aa  279  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
622 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
657 aa  270  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 
769 aa  264  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
983 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
859 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  32.02 
 
 
844 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
673 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
677 aa  254  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
853 aa  254  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
789 aa  254  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
962 aa  252  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1134 aa  252  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
668 aa  253  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
661 aa  252  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
660 aa  251  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 
1132 aa  251  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  36.25 
 
 
866 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
789 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
789 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
662 aa  247  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  38.37 
 
 
945 aa  247  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
802 aa  247  9e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
853 aa  247  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
857 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
1106 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  35.76 
 
 
892 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  29.61 
 
 
812 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
981 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 
651 aa  245  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
926 aa  245  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
653 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  38.12 
 
 
945 aa  243  9e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1140 aa  243  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
673 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  30.98 
 
 
678 aa  242  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
773 aa  243  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
639 aa  243  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
874 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
822 aa  242  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
796 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
711 aa  241  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
642 aa  241  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
888 aa  241  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
880 aa  241  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
637 aa  241  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
773 aa  240  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 
1019 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
867 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 
770 aa  239  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
796 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.52 
 
 
916 aa  239  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
643 aa  238  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
770 aa  238  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 
743 aa  237  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.88 
 
 
1121 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 
1215 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 
650 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
857 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
953 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1279 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
642 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
770 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 
774 aa  234  8.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>