More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1728 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 1171 aa  2344    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  55.36 
 
 		 1335 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  57.57 
 
 		 649 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  59.83 
 
 		 650 aa  446  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  52.6 
 
 		 619 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  46.21 
 
 		 1237 aa  359  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  67.53 
 
 		 740 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  60.08 
 
 		 793 aa  311  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  65.42 
 
 		 247 aa  298  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  66.83 
 
 		 212 aa  295  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  59.65 
 
 		 308 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  66.12 
 
 		 351 aa  272  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  65.28 
 
 		 345 aa  272  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  61.5 
 
 		 547 aa  265  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1126 aa  245  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1237  metal dependent phosphohydrolase  46.76 
 
 		 286 aa  232  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 1313 aa  229  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  31.81 
 
 		 1560 aa  227  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  37.02 
 
 		 1333 aa  223  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  57.59 
 
 		 367 aa  219  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  35.97 
 
 		 371 aa  213  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.24 
 
 		 880 aa  210  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 		 719 aa  210  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.48 
 
 		 860 aa  209  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 553 aa  206  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 718 aa  205  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 1629 aa  204  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 		 363 aa  204  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  30.75 
 
 		 571 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 776 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 526 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  50.52 
 
 		 357 aa  198  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  53.85 
 
 		 394 aa  198  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  50.72 
 
 		 320 aa  197  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 		 565 aa  197  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 357 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 357 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 574 aa  195  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  33.02 
 
 		 550 aa  196  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  50.54 
 
 		 349 aa  194  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 651 aa  194  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 373 aa  194  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  48.57 
 
 		 320 aa  194  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3638  metal dependent phosphohydrolase  52.54 
 
 		 252 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 1354 aa  193  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  52.72 
 
 		 1301 aa  192  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  51.79 
 
 		 375 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  51.79 
 
 		 391 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  31.02 
 
 		 632 aa  192  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  51.79 
 
 		 375 aa  191  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  43.39 
 
 		 438 aa  190  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  40.87 
 
 		 713 aa  189  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.28 
 
 		 348 aa  189  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 387 aa  189  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.84 
 
 		 491 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 861 aa  188  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  48.37 
 
 		 471 aa  187  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 		 562 aa  188  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 1135 aa  187  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  30.31 
 
 		 868 aa  187  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  42.06 
 
 		 710 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  48.91 
 
 		 350 aa  186  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 513 aa  185  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 		 465 aa  185  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  33.42 
 
 		 710 aa  184  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  31.8 
 
 		 792 aa  184  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 366 aa  184  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.34 
 
 		 496 aa  183  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  34.82 
 
 		 357 aa  184  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 		 703 aa  183  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.91 
 
 		 357 aa  183  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 		 347 aa  183  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  48.63 
 
 		 481 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  38.03 
 
 		 654 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 		 703 aa  181  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 		 407 aa  181  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  48.65 
 
 		 371 aa  180  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  40.08 
 
 		 698 aa  181  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 		 347 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  51.98 
 
 		 539 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  49.14 
 
 		 836 aa  178  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 548 aa  178  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.69 
 
 		 331 aa  178  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.28 
 
 		 348 aa  178  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  49.14 
 
 		 841 aa  178  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 		 692 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3723  response regulator receiver  45.27 
 
 		 338 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 		 508 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 1224 aa  175  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.87 
 
 		 487 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.98 
 
 		 354 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  38.46 
 
 		 771 aa  174  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.77 
 
 		 432 aa  173  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  47.72 
 
 		 518 aa  174  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  51.43 
 
 		 344 aa  174  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  37.05 
 
 		 467 aa  174  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 770 aa  174  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2370  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.2 
 
 		 370 aa  174  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.94 
 
 		 331 aa  173  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.26 
 
 		 346 aa  173  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>