More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3527 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
562 aa  1134    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  86.85 
 
 
565 aa  975    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  53.24 
 
 
574 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  48.43 
 
 
571 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 
371 aa  233  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  36.61 
 
 
357 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  34.89 
 
 
366 aa  217  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 
373 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 
403 aa  200  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  46.6 
 
 
713 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  30.74 
 
 
1171 aa  187  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  34.98 
 
 
650 aa  187  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  48.37 
 
 
698 aa  183  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
719 aa  180  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  31.52 
 
 
374 aa  180  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  33.25 
 
 
649 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  30.41 
 
 
550 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0051  metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 
407 aa  178  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 
718 aa  173  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 
363 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  27.31 
 
 
1335 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.06 
 
 
491 aa  171  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  47.49 
 
 
710 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  44.29 
 
 
740 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  47.75 
 
 
353 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
548 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  28.15 
 
 
861 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  50.29 
 
 
379 aa  164  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.44 
 
 
496 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  47.19 
 
 
509 aa  164  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 
247 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
508 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 
513 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  44.33 
 
 
792 aa  162  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.86 
 
 
348 aa  160  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  43.01 
 
 
481 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 
635 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  43.52 
 
 
320 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  41.58 
 
 
611 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  40.89 
 
 
424 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  43.46 
 
 
212 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.03 
 
 
357 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.03 
 
 
357 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.28 
 
 
841 aa  158  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  44.56 
 
 
836 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 
363 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  41.31 
 
 
648 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3114  metal dependent phosphohydrolase  41.43 
 
 
523 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00390297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  33.46 
 
 
692 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5034  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.55 
 
 
348 aa  157  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749308  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 
450 aa  156  8e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 
357 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.55 
 
 
379 aa  156  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  30.06 
 
 
770 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 
703 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0523  Response regulator protein  41.49 
 
 
359 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
703 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  44.94 
 
 
469 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.01 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  42.93 
 
 
308 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  29.49 
 
 
619 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  36.25 
 
 
718 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  39.34 
 
 
1237 aa  155  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.02 
 
 
860 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4963  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.43 
 
 
350 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102256  normal  0.0892849 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.02 
 
 
880 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3334  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.14 
 
 
331 aa  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 
407 aa  153  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  44.89 
 
 
268 aa  153  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.19 
 
 
353 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0458  response regulator receiver protein  45.25 
 
 
384 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  30.39 
 
 
848 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0399  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.25 
 
 
384 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.69 
 
 
331 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
1313 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 
331 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 
331 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 
331 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.51 
 
 
351 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2247  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.26 
 
 
518 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.77168  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2085  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 
345 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.012958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  39.09 
 
 
467 aa  151  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0492  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 
508 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0844408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  30.75 
 
 
632 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4913  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.73 
 
 
354 aa  150  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4449  metal-dependent phosphohydrolase  47.73 
 
 
358 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 
647 aa  150  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  39.22 
 
 
1333 aa  150  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 
465 aa  150  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
345 aa  150  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.89 
 
 
353 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 
606 aa  149  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  45.98 
 
 
344 aa  150  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  38.97 
 
 
499 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  42.71 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  41.15 
 
 
352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 
647 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.31 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0125166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>