More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2145 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  86.85 
 
 
562 aa  990    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
565 aa  1139    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  53.61 
 
 
574 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  47.15 
 
 
571 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 
357 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  36.16 
 
 
371 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
366 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 
373 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  30.98 
 
 
1171 aa  193  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  36.65 
 
 
650 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  34.36 
 
 
403 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 
414 aa  182  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  36.41 
 
 
649 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  48.91 
 
 
698 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
1335 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  29.09 
 
 
550 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 
553 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  46.04 
 
 
713 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0051  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 
407 aa  178  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 
374 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  31.52 
 
 
363 aa  174  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
719 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  25.04 
 
 
548 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.09 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  46.37 
 
 
710 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  47.75 
 
 
509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.14 
 
 
860 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.26 
 
 
880 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 
703 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  27.29 
 
 
861 aa  161  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  46.63 
 
 
353 aa  160  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
703 aa  160  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.06 
 
 
513 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 
718 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  49.14 
 
 
379 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  45.05 
 
 
792 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
496 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  30.51 
 
 
619 aa  157  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
692 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  37.6 
 
 
635 aa  156  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  38.08 
 
 
740 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  43.46 
 
 
212 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.96 
 
 
841 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  43.01 
 
 
836 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
1313 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
611 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.06 
 
 
508 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  43.01 
 
 
320 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.16 
 
 
348 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  30.13 
 
 
848 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.71 
 
 
351 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
481 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
718 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0523  Response regulator protein  40.96 
 
 
359 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  32.86 
 
 
1333 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  38.99 
 
 
407 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 
465 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 
247 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  47.13 
 
 
344 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  43.26 
 
 
469 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  29.04 
 
 
710 aa  150  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.14 
 
 
363 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0492  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
508 aa  150  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0844408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
499 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  27.97 
 
 
1237 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  39.44 
 
 
648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 
606 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4963  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.73 
 
 
350 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102256  normal  0.0892849 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 
424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
357 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 
632 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5034  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.46 
 
 
348 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749308  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
357 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 
467 aa  148  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.97 
 
 
357 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 
539 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  34.13 
 
 
712 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  41.15 
 
 
442 aa  147  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2247  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.45 
 
 
518 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.77168  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  42.41 
 
 
357 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 
770 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  42.37 
 
 
308 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4449  metal-dependent phosphohydrolase  46.59 
 
 
358 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 
654 aa  146  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3114  metal dependent phosphohydrolase  39.52 
 
 
523 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00390297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  44.92 
 
 
531 aa  146  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0399  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.3 
 
 
384 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 
331 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 
331 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0458  response regulator receiver protein  45.3 
 
 
384 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4913  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.59 
 
 
354 aa  146  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  40.19 
 
 
352 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 
320 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 
379 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
343 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0481  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.97 
 
 
348 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.63 
 
 
331 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 
418 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  39.35 
 
 
518 aa  145  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>