More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1408 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  55.66 
 
 		 647 aa  754    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  55.82 
 
 		 647 aa  754    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  51.91 
 
 		 636 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 654 aa  1339    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  46.03 
 
 		 760 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  46.58 
 
 		 635 aa  594  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.9 
 
 		 751 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.46 
 
 		 751 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.89 
 
 		 837 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0469  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.43 
 
 		 774 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  46.98 
 
 		 671 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 689 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 		 689 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 711 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 711 aa  349  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  41.87 
 
 		 371 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  38.03 
 
 		 1171 aa  183  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 		 366 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 		 574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 414 aa  171  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  33.83 
 
 		 770 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 		 363 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.48 
 
 		 491 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  36.95 
 
 		 632 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  48.42 
 
 		 792 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.4 
 
 		 841 aa  163  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  34.3 
 
 		 650 aa  161  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 571 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 487 aa  161  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  33.22 
 
 		 550 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  30.42 
 
 		 692 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  45.92 
 
 		 836 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  33.53 
 
 		 1335 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 		 513 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  44.26 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 357 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  31.15 
 
 		 619 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 		 547 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 		 547 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 		 703 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  32.01 
 
 		 1237 aa  155  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 		 502 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 496 aa  154  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 710 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  41.15 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 		 703 aa  154  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  36.63 
 
 		 561 aa  154  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 508 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  35.77 
 
 		 649 aa  153  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.09 
 
 		 506 aa  153  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 		 718 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 		 611 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  46.93 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 		 424 aa  151  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 		 719 aa  150  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  37.88 
 
 		 420 aa  150  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  29.14 
 
 		 712 aa  150  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  44.27 
 
 		 339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  36.69 
 
 		 771 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 		 469 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  36.03 
 
 		 710 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 		 247 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  46.02 
 
 		 450 aa  148  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 387 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  34.82 
 
 		 571 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 512 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 		 428 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 		 471 aa  147  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 		 306 aa  146  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  43.58 
 
 		 334 aa  146  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 		 444 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  34.1 
 
 		 565 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.22 
 
 		 351 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 562 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  37.13 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  40.29 
 
 		 212 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  41.99 
 
 		 467 aa  145  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  34.74 
 
 		 373 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.2 
 
 		 367 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 		 407 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  42.46 
 
 		 334 aa  144  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 		 448 aa  144  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  42.05 
 
 		 369 aa  144  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.05 
 
 		 369 aa  144  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 		 648 aa  144  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 		 320 aa  143  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 420 aa  144  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  29.12 
 
 		 642 aa  143  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1613  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 		 487 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350204  hitchhiker  0.000130728 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  29.12 
 
 		 642 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.13 
 
 		 343 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 643 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 		 350 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.74 
 
 		 338 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  43.33 
 
 		 868 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>