More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0469 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.48 
 
 		 689 aa  710    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  89.94 
 
 		 837 aa  1290    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.4 
 
 		 689 aa  716    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0469  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 774 aa  1594    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  39.59 
 
 		 671 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  48.51 
 
 		 647 aa  439  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  47.64 
 
 		 647 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  48.41 
 
 		 654 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 751 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  45.29 
 
 		 636 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 711 aa  399  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 711 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 751 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  43.25 
 
 		 635 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  40.48 
 
 		 760 aa  351  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.69 
 
 		 656 aa  236  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  54.84 
 
 		 654 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.5 
 
 		 1108 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.52 
 
 		 1047 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.1 
 
 		 1260 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.45 
 
 		 1047 aa  230  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.01 
 
 		 953 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.7 
 
 		 1113 aa  228  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.22 
 
 		 1260 aa  226  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.79 
 
 		 1279 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.37 
 
 		 1322 aa  219  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 		 677 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  48.09 
 
 		 525 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.78 
 
 		 849 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.62 
 
 		 983 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.79 
 
 		 664 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.22 
 
 		 1132 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 		 645 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 		 673 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  46.92 
 
 		 654 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.91 
 
 		 819 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  42.41 
 
 		 824 aa  211  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  50 
 
 		 844 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.18 
 
 		 828 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.12 
 
 		 773 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 		 796 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46 
 
 		 661 aa  208  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.95 
 
 		 796 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.11 
 
 		 663 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.22 
 
 		 859 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.13 
 
 		 692 aa  204  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.77 
 
 		 650 aa  203  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.7 
 
 		 692 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.9 
 
 		 853 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.7 
 
 		 954 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.48 
 
 		 773 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.25 
 
 		 643 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.34 
 
 		 637 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.02 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.58 
 
 		 639 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 		 962 aa  198  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 		 793 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 		 885 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.23 
 
 		 522 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.85 
 
 		 641 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.14 
 
 		 769 aa  193  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.01 
 
 		 864 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.67 
 
 		 751 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 		 817 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.98 
 
 		 1102 aa  190  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 657 aa  190  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.25 
 
 		 955 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.68 
 
 		 955 aa  190  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 470 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.96 
 
 		 1106 aa  188  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.96 
 
 		 752 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  48.44 
 
 		 1278 aa  187  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 		 1134 aa  187  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.33 
 
 		 840 aa  187  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.39 
 
 		 766 aa  187  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 		 753 aa  187  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.05 
 
 		 638 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4378  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.05 
 
 		 627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.055155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 642 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.91 
 
 		 711 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 		 668 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  42.13 
 
 		 1015 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 503 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.05 
 
 		 627 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1054 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1018 aa  185  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.37 
 
 		 831 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 		 1176 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0849  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.21 
 
 		 518 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.87 
 
 		 713 aa  183  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  46.61 
 
 		 733 aa  183  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  46.43 
 
 		 749 aa  183  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 		 798 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.75 
 
 		 642 aa  183  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 		 1021 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.25 
 
 		 845 aa  181  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 		 798 aa  181  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.84 
 
 		 752 aa  181  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1079 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>