More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1019 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
635 aa  1311    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  49.84 
 
 
647 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  49.2 
 
 
647 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  46.76 
 
 
636 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  46.41 
 
 
654 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  42 
 
 
760 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0469  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 
774 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 
837 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  39.18 
 
 
671 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
689 aa  348  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
689 aa  342  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
751 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
751 aa  327  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
711 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
711 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  42.19 
 
 
366 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
452 aa  182  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 
363 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 
548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.05 
 
 
491 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 
371 aa  178  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  40.16 
 
 
632 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 
574 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  45.81 
 
 
499 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 
648 aa  171  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
703 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 
770 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
703 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
719 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  38.87 
 
 
550 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  39.42 
 
 
561 aa  167  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
547 aa  167  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
547 aa  167  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 
718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
545 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
496 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 
357 aa  163  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 
513 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  47.06 
 
 
339 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 
481 aa  162  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.07 
 
 
363 aa  160  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  37.9 
 
 
553 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  38.31 
 
 
848 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 
373 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 
562 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  32.95 
 
 
571 aa  159  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
508 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  38.17 
 
 
512 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
692 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.21 
 
 
338 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.56 
 
 
841 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.68 
 
 
338 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.68 
 
 
338 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  37.6 
 
 
565 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  39.92 
 
 
713 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  46.86 
 
 
792 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.15 
 
 
338 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 
698 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.83 
 
 
880 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.83 
 
 
860 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 
247 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2902  response regulator receiver  45.2 
 
 
350 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.246098 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
405 aa  154  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.4 
 
 
357 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  38.27 
 
 
710 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 
339 aa  154  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  45.93 
 
 
518 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  40.09 
 
 
420 aa  154  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  46.81 
 
 
379 aa  154  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
438 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 
450 aa  154  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  43.09 
 
 
339 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0148  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.16 
 
 
385 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  29.89 
 
 
712 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  36.76 
 
 
771 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.32 
 
 
339 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  46.86 
 
 
836 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  33.58 
 
 
414 aa  151  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  29.72 
 
 
374 aa  151  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 
710 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
1237 aa  151  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 
357 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 
357 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  34.56 
 
 
740 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 
403 aa  150  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.03 
 
 
378 aa  150  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
424 aa  150  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  45.2 
 
 
382 aa  150  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0261  metal dependent phosphohydrolase  45.86 
 
 
245 aa  150  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  40.17 
 
 
571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  44.63 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.93 
 
 
357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  40.21 
 
 
876 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  35.66 
 
 
1301 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
420 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 
643 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.85 
 
 
338 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  31.04 
 
 
643 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 
643 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>