More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2856 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 339 aa  700    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  54.65 
 
 		 648 aa  193  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  51.38 
 
 		 547 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  52.84 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  51.38 
 
 		 547 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  47.49 
 
 		 770 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.2 
 
 		 496 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  51.69 
 
 		 718 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 		 428 aa  185  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  50.73 
 
 		 505 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  47.18 
 
 		 495 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  51.61 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  51.6 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  48.09 
 
 		 509 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 		 718 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  48.45 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  50.56 
 
 		 357 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  51.4 
 
 		 407 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  35.65 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.15 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.15 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.39 
 
 		 508 aa  178  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  48.35 
 
 		 792 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.93 
 
 		 526 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  50.28 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.09 
 
 		 841 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  41.52 
 
 		 618 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.85 
 
 		 880 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.01 
 
 		 487 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.85 
 
 		 860 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  47.54 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  48.35 
 
 		 836 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.65 
 
 		 498 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  45.96 
 
 		 430 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 		 487 aa  175  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  47.83 
 
 		 438 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  46.99 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  46.94 
 
 		 600 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  50.56 
 
 		 719 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  46.23 
 
 		 550 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.85 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  45.08 
 
 		 548 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  45.79 
 
 		 553 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  48.37 
 
 		 451 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  46.46 
 
 		 499 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  47.13 
 
 		 615 aa  172  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  49.41 
 
 		 248 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.84 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  47.12 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  46.91 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  43.82 
 
 		 876 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  48.9 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  47.73 
 
 		 428 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 		 469 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 		 506 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  52.73 
 
 		 177 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  47.73 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  44.98 
 
 		 632 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 545 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  49.12 
 
 		 220 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 		 692 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  42.5 
 
 		 545 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 		 451 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  45.74 
 
 		 1073 aa  169  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  45.88 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 513 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  39.27 
 
 		 710 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.39 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.63 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  45.08 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  49.39 
 
 		 210 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.45 
 
 		 502 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.25 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.88 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  42.62 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  42.78 
 
 		 563 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.83 
 
 		 378 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  45.79 
 
 		 571 aa  162  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 		 635 aa  162  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  38.53 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  45.05 
 
 		 574 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  44.89 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  42.71 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  42.71 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  42.71 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  43.37 
 
 		 703 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  42.71 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.93 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  42.71 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  46.39 
 
 		 561 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 		 960 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  36.5 
 
 		 467 aa  159  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>