More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1148 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
405 aa  827    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  47.98 
 
 
1301 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  41.86 
 
 
771 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  37.71 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  51.65 
 
 
480 aa  250  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  51.56 
 
 
334 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  50.47 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  47.2 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  53.93 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  55.38 
 
 
384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  52.38 
 
 
471 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  50.99 
 
 
469 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  49.48 
 
 
453 aa  209  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
359 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  55.06 
 
 
458 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  52.78 
 
 
492 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  50.55 
 
 
446 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  42.91 
 
 
848 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  44.23 
 
 
305 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  39.54 
 
 
452 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1511  hypothetical protein  45 
 
 
258 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  46.97 
 
 
643 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  46.97 
 
 
643 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  46.97 
 
 
643 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  49.44 
 
 
643 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  49.44 
 
 
643 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  45.6 
 
 
631 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  47.78 
 
 
357 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  47.78 
 
 
642 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  47.22 
 
 
642 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  47.22 
 
 
642 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 
358 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.51 
 
 
361 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.44 
 
 
364 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  46.49 
 
 
452 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 
363 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 
571 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 
648 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 
553 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  38.75 
 
 
718 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  36.97 
 
 
550 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  37.23 
 
 
719 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  36.33 
 
 
703 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  35.74 
 
 
703 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
1237 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 
770 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.58 
 
 
880 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.58 
 
 
860 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 
574 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
487 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  42.22 
 
 
1171 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  43.1 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
635 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 
710 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 
512 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  40.65 
 
 
713 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  43.82 
 
 
387 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  39.41 
 
 
547 aa  152  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  39.41 
 
 
547 aa  152  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 
428 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  38.65 
 
 
618 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  38.11 
 
 
740 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  44.25 
 
 
1073 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.25 
 
 
367 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  39.79 
 
 
247 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 
868 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  40.44 
 
 
495 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
357 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 
571 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  42.31 
 
 
509 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 
469 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  42.46 
 
 
467 aa  150  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  42.2 
 
 
545 aa  150  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  41.76 
 
 
377 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  41.18 
 
 
373 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  41.76 
 
 
377 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  41.18 
 
 
374 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  43.5 
 
 
649 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
545 aa  149  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 
451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  40.64 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  37.14 
 
 
760 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  41.44 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  44.38 
 
 
320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
615 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.11 
 
 
491 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  41.36 
 
 
212 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  41.71 
 
 
876 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  44.02 
 
 
326 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.2 
 
 
841 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  34.96 
 
 
692 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
197 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  38.43 
 
 
698 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  41.48 
 
 
462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  40.88 
 
 
1335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>