More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1320 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  100 
 
 
471 aa  972    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  42.82 
 
 
458 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  62.93 
 
 
848 aa  273  7e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  44.57 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  40.55 
 
 
474 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  53.04 
 
 
771 aa  242  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  39.6 
 
 
469 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  57.71 
 
 
1301 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  50.44 
 
 
389 aa  237  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  51.33 
 
 
480 aa  234  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  32.83 
 
 
452 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  59.68 
 
 
334 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  50.7 
 
 
453 aa  229  7e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  47.75 
 
 
389 aa  219  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  50.97 
 
 
305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.71 
 
 
492 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  47.75 
 
 
359 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  52.38 
 
 
405 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  52.88 
 
 
384 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  48.56 
 
 
358 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.86 
 
 
363 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
361 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  42.52 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  46.12 
 
 
357 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 
643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 
631 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 
642 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  42.44 
 
 
643 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  42.44 
 
 
643 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  42.44 
 
 
643 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  43.41 
 
 
642 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  42.44 
 
 
643 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
642 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
984 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1938  PAS/PAC domain-containing protein  29.88 
 
 
632 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.98 
 
 
853 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  41.99 
 
 
446 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
1121 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1120  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
805 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37757  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.43 
 
 
364 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  43.65 
 
 
465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  28.83 
 
 
632 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
1692 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  34.51 
 
 
339 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
535 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  25.61 
 
 
483 aa  157  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
428 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
1309 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
424 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  40 
 
 
803 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0567  putative PAS/PAC sensor protein  32.33 
 
 
693 aa  151  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.79 
 
 
379 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
968 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  32.69 
 
 
1109 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 
495 aa  150  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.8 
 
 
1278 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  40.7 
 
 
792 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
1253 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.2 
 
 
1338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1974  putative PAS/PAC sensor protein  31.88 
 
 
701 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  41.46 
 
 
308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 
681 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  35.32 
 
 
487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  40.21 
 
 
876 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0162  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 
837 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 
635 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  38.83 
 
 
371 aa  146  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3834  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.63 
 
 
908 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  31.42 
 
 
311 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.8 
 
 
755 aa  146  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 
1113 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 
367 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  44.07 
 
 
382 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  28.16 
 
 
740 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  37.26 
 
 
571 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  40.87 
 
 
353 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  42.22 
 
 
469 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
761 aa  144  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.44 
 
 
841 aa  143  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  40.3 
 
 
531 aa  143  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  42.44 
 
 
836 aa  143  7e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.77 
 
 
1134 aa  143  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
518 aa  143  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.07 
 
 
1413 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564112  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  41 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 
212 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
526 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
491 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0148  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 
385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 
1078 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  37.62 
 
 
710 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.89 
 
 
860 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
766 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.89 
 
 
880 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 
619 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
547 aa  140  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 
547 aa  140  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>