More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1817 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
446 aa  880    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  49.75 
 
 
469 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  52.66 
 
 
389 aa  210  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  53.19 
 
 
389 aa  210  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  45.37 
 
 
474 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 
480 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  50.55 
 
 
405 aa  204  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  42.79 
 
 
1301 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  42.91 
 
 
642 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  42.91 
 
 
642 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 
631 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  38.8 
 
 
771 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  48.56 
 
 
643 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  48.56 
 
 
643 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  48.56 
 
 
643 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  48.56 
 
 
643 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.6 
 
 
384 aa  202  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
642 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  51.09 
 
 
334 aa  199  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 
492 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  49.48 
 
 
643 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  43.9 
 
 
341 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 
452 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  46.31 
 
 
453 aa  194  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 
458 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  44.72 
 
 
359 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  47.89 
 
 
305 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  37.4 
 
 
848 aa  187  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  42.38 
 
 
452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 
358 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
361 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 
495 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  42.78 
 
 
357 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.19 
 
 
363 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
770 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  41.99 
 
 
471 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
547 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  36.51 
 
 
547 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 
465 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 
1171 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  42.4 
 
 
545 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  41.92 
 
 
499 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 
247 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  35.11 
 
 
619 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  36.64 
 
 
1335 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 
718 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
496 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.94 
 
 
841 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  39.2 
 
 
710 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 
364 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 
363 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 
518 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  39.22 
 
 
467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
513 aa  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  41.09 
 
 
792 aa  152  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.93 
 
 
1073 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  44.63 
 
 
438 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  39.7 
 
 
713 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  41.9 
 
 
207 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  40.19 
 
 
615 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  36.02 
 
 
649 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  34.93 
 
 
650 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.79 
 
 
506 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  42.53 
 
 
836 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
698 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 
366 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.17 
 
 
868 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  35.68 
 
 
740 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  45.56 
 
 
210 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  33.89 
 
 
876 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  37.67 
 
 
632 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 
487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  37.6 
 
 
618 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
571 aa  146  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 
508 aa  146  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 
339 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  38.8 
 
 
692 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  35.41 
 
 
651 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
648 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 
428 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.58 
 
 
471 aa  144  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  38.69 
 
 
311 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  34.95 
 
 
212 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 
1237 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 
861 aa  144  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  41.86 
 
 
424 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 
326 aa  144  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  41.21 
 
 
220 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  39.55 
 
 
509 aa  143  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  37.06 
 
 
424 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 
448 aa  143  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  37.99 
 
 
703 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
391 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  39.33 
 
 
226 aa  142  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 
368 aa  142  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 
462 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>