More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3002 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
469 aa  951    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  55.09 
 
 
458 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  50.85 
 
 
474 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  44.06 
 
 
341 aa  253  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 
480 aa  253  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  39.6 
 
 
471 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  55.34 
 
 
848 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  56.63 
 
 
334 aa  230  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  52.31 
 
 
389 aa  230  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  54.73 
 
 
771 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  52.02 
 
 
1301 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  54.19 
 
 
492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  51 
 
 
358 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  47.25 
 
 
453 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  55.9 
 
 
384 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  49.75 
 
 
446 aa  211  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  50.99 
 
 
405 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  44.21 
 
 
359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
643 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  47.85 
 
 
305 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  44.33 
 
 
642 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
643 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
643 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
643 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
643 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  44.33 
 
 
642 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  51 
 
 
363 aa  196  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  43.84 
 
 
642 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  38.65 
 
 
452 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
361 aa  193  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  51.69 
 
 
389 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  41.87 
 
 
631 aa  186  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
513 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  43.46 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  50.59 
 
 
257 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
953 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  48.17 
 
 
357 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 
989 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.31 
 
 
989 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.85 
 
 
364 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
498 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
499 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
508 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  39.69 
 
 
465 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  35.85 
 
 
429 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  38.31 
 
 
495 aa  149  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  37.37 
 
 
632 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 
357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.55 
 
 
704 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.78 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.01 
 
 
357 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.01 
 
 
357 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.25 
 
 
455 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  40.55 
 
 
357 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  41.94 
 
 
876 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  36.5 
 
 
603 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  31.53 
 
 
311 aa  144  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
343 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  44.25 
 
 
550 aa  142  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.18 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  33.85 
 
 
273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  41.14 
 
 
648 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
487 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.86 
 
 
701 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  31.86 
 
 
339 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  38.83 
 
 
868 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
340 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.12 
 
 
377 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.43 
 
 
701 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  42.21 
 
 
311 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.88 
 
 
591 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
545 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.86 
 
 
426 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
571 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
713 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  42.11 
 
 
509 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  51.91 
 
 
636 aa  136  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
703 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  40 
 
 
712 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.94 
 
 
526 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 
698 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
703 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  42.68 
 
 
836 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  42.68 
 
 
792 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 
571 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.81 
 
 
487 aa  134  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  39.41 
 
 
261 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.68 
 
 
841 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  41.46 
 
 
337 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  38.76 
 
 
861 aa  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 
373 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  41.67 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4475  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
249 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118012  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  49.21 
 
 
131 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>