More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3421 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
341 aa  702    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  43.43 
 
 
474 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  44.57 
 
 
471 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  41.69 
 
 
458 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  44.06 
 
 
469 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  59.28 
 
 
771 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  52.02 
 
 
389 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  56.25 
 
 
480 aa  232  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  58.08 
 
 
848 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  57.14 
 
 
334 aa  229  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  57.3 
 
 
1301 aa  225  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  40.45 
 
 
452 aa  225  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.45 
 
 
492 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  47.2 
 
 
405 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  50.52 
 
 
631 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.1 
 
 
384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  51.72 
 
 
359 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  48.06 
 
 
453 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  48.94 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 
446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  45.36 
 
 
643 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  45.18 
 
 
642 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  46.77 
 
 
305 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  45.18 
 
 
642 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  44.67 
 
 
642 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  44.67 
 
 
643 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  44.67 
 
 
643 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  44.67 
 
 
643 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  44.67 
 
 
643 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.28 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  42.45 
 
 
357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  45.6 
 
 
452 aa  182  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  44.02 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
361 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 
364 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  42.33 
 
 
632 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 
648 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
487 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  44.51 
 
 
465 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  34.07 
 
 
339 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  42.57 
 
 
495 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  42.41 
 
 
615 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  44.69 
 
 
509 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  40.93 
 
 
518 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 
469 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  35.56 
 
 
836 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  40.72 
 
 
618 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  36.75 
 
 
876 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 
545 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  35.19 
 
 
792 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
371 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  40.28 
 
 
407 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.74 
 
 
841 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
481 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 
428 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 
444 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.45 
 
 
491 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  37.74 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  36.2 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  39.79 
 
 
438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.84 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 
451 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  41.75 
 
 
574 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  43.65 
 
 
462 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  39.78 
 
 
430 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  42.54 
 
 
451 aa  145  9e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 
526 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.8 
 
 
343 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 
713 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 
328 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  41.62 
 
 
353 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.5 
 
 
1073 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  35.81 
 
 
308 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  35.66 
 
 
547 aa  143  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.93 
 
 
508 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1974  putative PAS/PAC sensor protein  33.55 
 
 
701 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  35.66 
 
 
547 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  32.91 
 
 
311 aa  143  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  46.33 
 
 
571 aa  143  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  39.8 
 
 
373 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 
770 aa  142  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  39.8 
 
 
374 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  39.8 
 
 
377 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  39.8 
 
 
377 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 
905 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  40.44 
 
 
698 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  41.99 
 
 
553 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  39.65 
 
 
718 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0899  hypothetical protein  40.56 
 
 
294 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000973065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  34.02 
 
 
740 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  39.29 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  38.35 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  40.64 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.27 
 
 
357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
710 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
868 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  40.66 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  36.33 
 
 
571 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  36.03 
 
 
649 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>