More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0887 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
496 aa  1006    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  52.62 
 
 
487 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.96 
 
 
513 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 
508 aa  339  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
491 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 
526 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.53 
 
 
506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 
498 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 
502 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  42.8 
 
 
632 aa  210  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  41.8 
 
 
692 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  33.52 
 
 
550 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  40.08 
 
 
553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  45.24 
 
 
718 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  38.84 
 
 
547 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  38.84 
 
 
547 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  44.93 
 
 
719 aa  191  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  43.14 
 
 
713 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.4 
 
 
841 aa  190  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  38.4 
 
 
357 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  42.59 
 
 
618 aa  189  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 
407 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 
492 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  45.18 
 
 
792 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  41.2 
 
 
339 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  38.52 
 
 
710 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 
615 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  39.34 
 
 
1171 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  41.63 
 
 
561 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 
373 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  45.31 
 
 
836 aa  183  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
366 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  46.55 
 
 
1073 aa  182  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  39.51 
 
 
712 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
703 aa  181  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 
371 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
703 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  45.31 
 
 
499 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  44.85 
 
 
698 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  47.51 
 
 
430 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.54 
 
 
880 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.54 
 
 
860 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  40.25 
 
 
387 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.27 
 
 
343 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  45.26 
 
 
876 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
548 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  42.38 
 
 
718 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 
710 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  38.08 
 
 
770 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  46.49 
 
 
220 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
331 aa  174  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 
481 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  47.22 
 
 
317 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  47.22 
 
 
317 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
648 aa  173  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
444 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  45.4 
 
 
509 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 
452 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.41 
 
 
331 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 
518 aa  170  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 
650 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  36.4 
 
 
793 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 
328 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  43.96 
 
 
451 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  43.56 
 
 
571 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  43.55 
 
 
611 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  41.99 
 
 
495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  37.96 
 
 
649 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  40.93 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 
545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  43.39 
 
 
207 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  36.48 
 
 
599 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  41.12 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  45.93 
 
 
469 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  37.75 
 
 
339 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
635 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  37.44 
 
 
562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  37.44 
 
 
212 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
505 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  33.6 
 
 
619 aa  163  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  42.78 
 
 
334 aa  163  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1118  metal dependent phosphohydrolase  47.22 
 
 
317 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  43.17 
 
 
334 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.81 
 
 
334 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  42.46 
 
 
196 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  44.75 
 
 
905 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 
465 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  36.32 
 
 
247 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  41.71 
 
 
377 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  41.71 
 
 
373 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  41.71 
 
 
373 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 
197 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  41.71 
 
 
377 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 
326 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  41.71 
 
 
374 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  37.22 
 
 
374 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>