More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3393 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 448 aa  929    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  64.73 
 
 		 456 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  55.17 
 
 		 461 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  55.17 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  51.48 
 
 		 460 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  49.88 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  34.16 
 
 		 525 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 		 526 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 526 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 		 526 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 		 521 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 		 347 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  28.95 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  31.72 
 
 		 519 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 		 400 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 524 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 		 392 aa  170  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0297  metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2407  HD domain-containing protein  29.02 
 
 		 415 aa  161  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00855664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 		 710 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  41.92 
 
 		 518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 		 713 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  39.15 
 
 		 571 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  29.43 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  32.23 
 
 		 424 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  45.93 
 
 		 465 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 698 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 		 420 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  39.45 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  33.46 
 
 		 1171 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  30.63 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 		 422 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 		 718 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  35.09 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 		 654 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  42.26 
 
 		 635 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.95 
 
 		 348 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 		 553 aa  143  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 		 446 aa  143  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  37.68 
 
 		 876 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  40.49 
 
 		 547 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  33.6 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  40.49 
 
 		 547 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0899  hypothetical protein  41.62 
 
 		 294 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973065 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 611 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.78 
 
 		 364 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0194  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  43.53 
 
 		 177 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  39.43 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  45.4 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  34.4 
 
 		 632 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  37.63 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  41.28 
 
 		 649 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  40.7 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 		 770 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  40.57 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  38.82 
 
 		 647 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  30.32 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 		 648 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 545 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  35.41 
 
 		 550 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 		 407 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  35.87 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 		 574 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2855  HDIG  29.77 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.57 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 		 647 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  41.82 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  38.8 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 		 710 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  38.8 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  41.04 
 
 		 320 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  38.8 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  38.8 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  39.23 
 
 		 760 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 		 495 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  35.41 
 
 		 417 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  39.43 
 
 		 650 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 		 345 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1640  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 		 471 aa  133  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.22 
 
 		 498 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>